В 1981 г. закончила Куйбышевский медицинский институт им. Д.И. Ульянова.
Елена Владимировна имеет сертификат по специальности «Организация здравоохранения и общественное здоровье», по специальности «Неврология», по специальности «Рефлексотерапия»
Костенко Елена Владимировна- член Межрегиональной общественной организации специалистов ботулинотерапии; член общероссийской общественной организации содействия развитию медицинской реабилитации «Союз реабилитологов России»; член общества европейских экспертов по физической и реабилитационной медицине, член Президиума Всероссийского общества неврологов, член ассоциации Междисциплинарной медицины.
Область научных интересов Костенко Е.В. включает неврологию, проблемы медицинской реабилитации пациентов с нарушением функции центральной и периферической нервной системы.
Елена Владимировна занимается совершенствованием диагностической и лечебно-реабилитационной помощью пациентам после перенесенного инсульта и черепно-мозговой травмы, при вертеброгенных заболеваниях нервной системы, хронических болевых синдромах, в том числе головной боли, при экстрапирамидных и демиелинизирующих заболеваниях.
Руководитель международных и отечественных клинических исследований II-IV фаз, научно-исследовательских и диссертационных работ. Куратор профессионально подготовки специалистов в клинической ординатуре по специальности «неврология».