В 1988 г. с отличием закончил лечебный факультет 2-го МОЛГМИ им. Н.И. Пирогова, после прохождения интернатуры с 1989 по 1995 г. работал врачом пульмонологом Калужской областной больницы.
С 1996 по 1999 г. проходил обучение в аспирантуре НИИ пульмонологии Минздрава России.
В 1999 г. защитил кандидатскую диссертацию на тему: «Методологические подходы к диагностике и лечению синдрома хронического кашля».
С 2000 по 2003 г. работал директором медицинского центра «Элита» в г. Калуге.
С 2003 по 2009 г. – заместитель директора по научной работе НИИ пульмонологии Минздрава России.
В 2008 г. защитил докторскую диссертацию на тему: «Эмфизема легких у больных ХОБЛ: современные аспекты патогенеза, диагностики и лечения».
С 2009 г. работал в должности заместителя генерального директора по научной работе и медицинским технологиям ФНКЦ ФМБА России (до реорганизации Клиническая больница № 83 ФМБА России), с января 2014 г. – главный врач клиники. А.В. Аверьянов – один из разработчиков «Концепции развития пульмонологической помощи населению Российской Федерации 2004-2008 гг.» Минздрава России.
Александр Вячеславович является автором более 120 печатных работ, соавтором 4-х монографий: «Руководство по респираторной медицине» в 2-х томах, «Пульмонология. Национальное руководство», «Хроническая обструктивная болезнь легких», «Эмфизема легких», стандартов медицинской помощи (при оказании специализированной помощи) Минздравсоцразвития России 2006-2007 гг. при пневмонии, ХОБЛ, бронхиальной астме, остром бронхите.
С июня 2014 г. назначен главным экспертом-пульмонологом Федерального медико-биологического агентства.