В 1971 с отличием окончил лечебный факультет 1-й медицинского института им. И.П. Павлова.
Кандидатская диссертация Владимира Леонидовича была посвящена экспериментальным и клиническим исследованиям новых методов диагностики в нефрологии. Эти методы легли в основу изучения ренальных дисфункций в терапии, пульмонологии, эндокринологии, акушерстве и других направлениях. В 1997 году защитил докторскую диссертацию. В 1998 году Владимиру Леонидовичу Эмануэлю присвоено звание профессора.
В.Л. Эмануэль является автором более 300 научных работ, имеет патенты на способы диагностики уролитиаза, лечения больных с ишемическими цереброваскулярными заболеваниями, оценки качества клинических лабораторных исследований, а также на растительный сбор для лечения больных с тромбоокклюзирующими поражениями артерий головы и шеи. Автор 10 монографий, посвященных разработке и применению биофизических технологий и методов медицинской информатики.
Владимир Леонидович возглавляет Ассоциацию медицинской лабораторной диагностики по Санкт-Петербургу и Ленинградской области, является вице-президентом Ассоциации «Федерация лабораторной медицины».