Работает на кафедре с 1970г., в должности заведующей кафедрой - с 2005г. В 1978 г. защитила кандидатскую диссертацию на тему «Некоторые показатели иммунитета при системной красной волчанке у детей», в 1993г. – докторскую диссертацию на тему «Эффективность немедикаментозных методов в комплексной терапии бронхиальной астмы у детей».
Сфера научных интересов: пульмонология, аллергология, ревматология, вопросы реабилитации у детей, неонатология.
Автор более 300 научных и учебно-методических публикаций, в том числе (за последние 5 лет) – 4х монографий и руководства по детской ревматологии.
В 2006-2010гг. под редакцией Н.А.Геппе создано 3 учебника:
Пропедевтика детских болезней/под ред. Н.А.Геппе, Н.С.Подчерняевой: учебник для студентов медицинский вузов. - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2008. При создании учебника использован инновационный подход к структуре изложения материала, учебник снабжен таблицами диагностического поиска, богато иллюстрирован.
Педиатрия/под ред. проф. Н.А.Геппе: учебник для студентов, обучающихся по специальности «Стоматология». - М.: ГЭОТРАР-Медиа, 2009.
Детские болезни/под ред. Н.А. Геппе, Г.А. Лыскиной: учебник для студентов ФВСО - М., «Медицина» «Шико», 2008.
Является одним из создателей, руководителей и координаторов Национальных программ: «Бронхиальная астма у детей» (1997, 2006, 2008)», «Аллергический ринит у детей» и «Атопический дерматит у детей». Под руководством профессора Н.А.Геппе на кафедре созданы 9 учебных видеофильмов.
Автор многочисленных устных и стендовых докладов на Всероссийских и международных симпозиумах и конгрессах (в 2006-2010 годах – 113).
Под руководством Геппе Н.А. подготовлено и защищено 44 диссертации докторов и кандидатов медицинских наук.
В 2006-2010 годах сотрудники кафедры детских болезней под руководством и при непосредственном участии Н.А.Геппе выполняли:
1. Работы по государственному контракту № 11-Д от 20.03.2006г. по комплексу профилактических мероприятий, направленных на противодействие эпидемии ВИЧ/СПИДа в Российской Федерации в рамках «Приоритетного национального проекта в сфере здравоохранения» в 2006г. по лоту №3 «Мероприятия, направленные на профилактику передачи ВИЧ-инфекции от матери ребенку».
2. Проект «Обеспечение специализированной медицинской помощью подростков, проживающих в условиях Крайнего Севера и прилегающих территорий» (в рамках Федеральной целевой программы «Дети России» на 2007г.).
3. Проект «Разработка новых лечебно-оздоровительных технологий совершенствования оказания медицинской помощи подросткам допризывного возраста» (в рамках Федеральной целевой программы «Дети России» на 2007г.).
4. Работы по комплексу профилактических мероприятий, направленных на противодействие эпидемии ВИЧ/СПИДа в Российской Федерации в рамках государственного контракта по «Приоритетному национальному проекту в сфере здравоохранения» в 2009 году по лоту «Мероприятия, направленные на профилактику передачи ВИЧ от матери ребенку».
5. Создание модульной программы по дисциплине «Педиатрия» для специальности «Лечебное дело» (В рамках инновационного проекта «Образование», 2006г.).
6. Создание медиатеки по дисциплине «Педиатрия» для специальности «Лечебное дело» (В рамках инновационного проекта «Образование», 2007г.).
Председатель Диссертационного совета Первого МГМУ им. И.М. Сеченова и член Диссертационного Совета при РГМУ им. Н.И.Пирогова. Член Ученого Совета, Научно-экспертного Совета и Совета Старейшин Первого МГМУ им. И.М. Сеченова. Член экспертного Совета Высшей аттестационной комиссии Минобрнауки. Член Исполкома российского респираторного общества и Европейского респираторного общества. Заместитель председателя Федерации педиатров стран СНГ. Председатель секции пульмонологов Московского общества детских врачей. Член редколлегии журналов «Пульмонология», «Вопросы практической педиатрии», «Педиатрия», «Доктор.Ру», «Consilium medicum», «Педиатрия, акушерство и гинекология» (Украина), «Церковь и медицина». Член экспертного совет Федерального руководства по использованию лекарственных средств МЗСР. Является одним из руководителей мультидисциплинарного образовательного проекта «ОЛИМП» (Основы клинической иммунология для педиатров).
Профессором Н.А. Геппе совместно с профессором В.С. Малышевым (МАИ) был разработан принципиально новый метод функциональной диагностики – бронхофонография, основанный на анализе амплитудно-частотных характеристик звуковой дыхательной волны.
Профессор Геппе Н.А. является директором клиники детских болезней (Университетская детская клиническая больница), координирует лечебную работу и возглавляет лечебный совет клиники, осуществляет контроль за качеством обследования и лечения пациентов.