Руководит кафедрой терапии с курсами эндокринологии, функциональной и ультразвуковой диагностики Тюменской Государственной Медицинской Академии с 1994 года.
Сергей Михайлович - автор более 200 научных трудов, монографий, имеет 9 патентов на изобретения. Область научных интересов - диагностика и лечение сердечно-сосудистых и легочных заболеваний. Под его руководством на кафедре были выполнены и защищены 1 докторская и 15 кандидатских диссертаций.
С.М. Кляшев является членом аттестационной комиссии департамента здравоохранения Тюменской области, членом врачебной комиссии департамента здравоохранения Тюменской области, возглавляет областную терапевтическую ассоциацию с 2002 года.