В 1974 г. окончил с отличием 1 ММИ им.И.М.Сеченова, в 1974-76 гг. – работал в клинической ординатуре, в 1976-79 гг. – проходил обучение в аспирантуре, 1979-1990 гг. – ассистент кафедры факультетской терапии № 1 лечебного факультета, 1990-2002 гг. – доцент кафедры, 2002-2007 гг. – профессор кафедры. С 2007 г. – заведующий кафедрой факультетской терапии №2 лечебного факультета ММА (ныне - ПМГМУ).
В 1981 г. защитил кандидатскую диссертацию, в 1994 г. – докторскую диссертацию.
Приоритетными направлениями научной деятельности являются исследования в области гендерной кардиологии, диагностики и лечения метаболического синдрома, кардиоренальных взаимоотношений. Является признанным авторитетом в области изучения состояния микроциркуляции при гипертонической болезни и им предложена концепция ведущей роли микроциркуляторных нарушений в генезе развития и прогрессирования поражения органов-мишеней при гипертонической болезни. Одним из первых в России начал изучать особенности диагностики и лечения кардиологических нарушений при естественной и хирургической менопаузе. Внес вклад в изучение поражения сердца при хронической алкогольной болезни.
Является автором более 350 научных работ, 9 монографий, книг и глав в руководствах. Под руководством В.И.Подзолкова подготовлено 17 кандидатов медицинских наук, выполняется несколько докторских и кандидатских диссертаций. Постоянно участвует и выступает с докладами на национальных и международных конгрессах и съездах.
Состоит членом Европейского общества кардиологов, членом правления Всероссийского научного общества кардиологов, членом президиума правления и председателем секции гендерной и возрастной гипертензиологии Российского медицинского общества по артериальной гипертонии, академиком Российской академии медико-технических наук, членом редколлегий журналов «Кардиоваскулярная терапия и профилактика», «Рациональная фармакотерапия в кардиологии», «Сердце», «Сердечная недостаточность», «Системные гипертензии», «Эффективная фармакотерапия в кардиологии и ангиологии».
За внедрение научных достижений и передового опыта в кардиологическую практику Валерию Ивановичу Подзолкову присуждена Национальная премия в области кардиологии "Пурпурное сердце". 27 апреля 2010 года на Торжественной Церемония была вручена специальная премия «Личный вклад в развитие отечественной кардиологии».