В 1974 году закончил физический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова по специальности биофизика. В 1981 году защитил кандидатскую диссертацию, а в 1995 году – докторскую диссертацию.
С 2008 года Владимир Васильевич заведует отделом биоинформатики Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича».
Сфера научных интересов: молекулярное моделирование, распознавание образов, биоинформатика, сравнительная геномика, компьютерная химия, компьютерное конструирование лекарств, постгеномные технологии.
Владимир Васильевич награжден Золотым знаком Международного Фонда «Научное партнерство» за вклад в развитие российской науки и активное международное сотрудничество (2010), а также имеет Diploma and Medal of the Fifth Moscow International Congress “Biotechnology: State of the Art and Prospects of Development” (2009), Diploma of Cambridge Biographic Institute (Leading Scientistin Bioin for matics and Computer-Aided Drug Discovery) (2005), Диплом Российской академии медицинских наук (2004).