Фаиль Таипович окончил в 1980 году, I Московский медицинский институт им.И.М.Сеченова (диплом с отличием по специальности лечебное дело). В 1980-82 гг. обучался в Клинической ординатуре ведущего кардиологического учреждения нашей страны - НИИ кардиологии им. А.Л.Мясникова. После окончания Клинической аспирантуры НИИ кардиологии им. А.Л.Мясникова РКНПК МЗРФ (1982-85 гг) успешно защитил кандидатскую диссертацию в 1985 году по проблемам лечения желудочковых аритмий при сердечной недостаточности («Применение новых отечественных антиаритмических препаратов этмозина и этацизина при желудочковых нарушениях ритма сердца у больных с сердечной недостаточностью»).
В 1985 году в составе коллектива авторов стал лауреатом премии Ленинского Комсомола за работу «Новые подходы к лечению рефрактерной сердечной недостаточности». В 1995 г. защищена докторская диссертация (тема: Влияние медикаментозной терапии на течение заболевания, качество жизни и прогноз больных с различными стадиями хронической сердечной недостаточности). Область научных интересов Агеева Ф.Т. включает в себя следующие нозологии: хроническая сердечная недостаточность и причины ее развития (артериальная гипертония, ишемическая болезнь сердца и т.д.) эпидемиология сердечно-сосудистых заболеваний, амбулаторное ведение сердечно-сосудистых больных, клинические испытания, регенеративная (клеточная) терапия.
В 1999 году Фаиль Таипович стал одним из организаторов «Общества специалистов по сердечной недостаточности» - общественной организации, целью которой является объединение усилий ученых, врачей, фармацевтов, общественных деятелей в борьбе с эпидемией сердечной недостаточности. В рамках ОССН участвовал в организации выпуска 2 популярных журналов (Сердечная недостаточность и Сердце) тиражом более 15 тысяч экземпляров. Стал одним из организаторов «Школ ОССН по сердечной недостаточности» - пропагандиста современных методов диагностики и лечения ХСН, исследований по эпидемиологии ХСН (ЭПОХА).
Научная деятельность Агеева Ф.Т. неразрывно связана с лечебной работой. В 2002 г. становится руководителем научно-диспансерного отдела НИИ кардиологии им.А.Л.Мясникова РКНПК. В настоящее время -- главный научный сотрудник НИИ кардиологии им. А.Л. Мясникова ФГБУ "НМИЦК им. ак. Е.И. Чазова" Минздрава России (Москва, Россия).
Агеев Ф.Т. осуществлял организацию и участвовал в эпидемиологических исследованиях по распространенности хронической сердечной недостаточности (ХСН) (ЭПОХА ХСН и ЭПОХА-О-ХСН); разрабатывает методы диагностики и лечения ХСН, в частности, диастолической ХСН, сочетанных форм ХСН и сахарного диабета, изучал роль диастолических расстройств в патогенезе и клинических проявлениях различных сердечно-сосудистых заболеваний, разрабатывает методы амбулаторного ведения больных с ХСН с элементами обучения и реабилитации (программа ШАНС) и методы амбулаторного ведения больных артериальной гипертонией, в том числе осложненного течения.
Агеев Ф.Т. имеет около 150 опубликованных научных статей и тезисов в отечественной и зарубежной литературе, две монографии: (Медикаментозные пути улучшения прогноза больных хронической сердечной недостаточностью» М. Инсайт, 1997; «Ингибиторы АПФ в лечении сердечно-сосудистых заболеваний («Квинарил и эндотелиальная дисфункция» М. Инсайт, 2000).
