После окончания 1-го ММИ им. И.М. Сеченова в 1979 года всю свою профессиональную деятельность посвятил эндокринологии. В настоящее время работает главным врачом Эндокринологического диспансера Департамента здравоохранения города Москвы. На протяжении последних 20 лет руководит эндокринологической службой Москвы в качестве главного эндокринолога Департамента здравоохранения города. При активном личном участии М.Б. Анциферова создавалась система специализированной медицинской помощи пациентам с эндокринными заболеваниями в медицинских организациях Департамента здравоохранения города Москвы: окружные эндокринологические отделения, кабинеты диабетической стопы, школы для больных сахарным диабетом.
Является членом президиумов Российской и Московской ассоциаций эндокринологов, членом Европейской ассоциации изучения диабета (EASD), членом редколлегии медицинских научных журналов: «Проблемы эндокринологии», «Сахарный диабет», «Фарматека», «Эндокринология» и др. Является экспертом Общественной палаты города Москвы, членом Президиума Российской ассоциации эндокринологов, членом профильной комиссии Минздрава РФ по специальности «Эндокринология».
Под руководством М.Б. Анциферова защищено 16 кандидатских диссертаций. В течение многих лет преподавал на кафедре детской эндокринологии ФППО Первого МГМУ им. И.М. Сеченова. В настоящее время работает на кафедре эндокринологии и диабетологии РМАПО МЗ РФ.
Михаилом Борисовичем опубликовано более 400 научных работ, из них - около 100 за рубежом, издано 5 монографий и ряд клинических руководств.
