Сергей Викторович окончил Ставропольский государственный медицинский институт в 1994 г. 

В 1994-1996 гг. обучался в клинической ординатуре по специальности «Детская хирургия» СтГМА. 

В 1998 г. защитил кандидатскую диссертацию, в 2004 г. защитил диссертацию на соискание учёной степени доктора медицинских наук. В 2008 г. Минаеву С.В. присвоено учёное звание профессора по кафедре детской хирургии. 

Профессор Минаев является автором более 350 публикаций, 2 монографий, 2 электронных изданий для студентов, 10 учебных и учебно-методических пособия, 6 практических руководств для врачей. Имеет 10 патентов на изобретения и полезные модели, 2 рационализаторских предложения. 

Под руководством Минаева С.В. защищено 21 кандидатских и 1 докторская диссертация.